Для защиты информации от несанкционированного доступа использую:

- на локальном компе - DiskCryptor. Умеет зашифровывать разделы без потери информации (в отличие от TrueCrypt). Правда, надо набраться терпения при шифровании.
В систему устанавливается драйвер. В начале работы запускаю через runas  с правами админа, монтирую диски и закрываю прогу.

- для шифрования информации на флешке - TrueCrypt в портабельном варианте. Создаю зашифрованный файловый контейнер и кидаю саму прогу на флешку.