Решение проблемы со скрытыми файлами:

1. Очистка ОС от вредоносных программ.

2. Пуск -> Выполнить -> ввести без кавычек "regsvr32 /i shell32.dll" - ok.

3. Идем в реестр: Пуск -> Выполнить -> ввести без кавычек "regedit" - ok.

Находим ключ:
HKey_Local_Machine\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\Advanced\Folder\Hidden\SHOWALL
- Удаляем параметр CheckedValue в правом окне.

* Щёлкаем правой кнопкой мыши в этом же окне (справа) и выбираем «создать > параметр DWORD».
(Если параметр "CheckedValue" уже есть и имеет тип REG_DWORD, то достаточно изменить его значение с "0" до "1".)
Даем ему имя B>CheckedValue. Ставим значение «1» (0x00000001) и нажимаем ОК. 

4. Заходим в «Сервис» > «Свойства папки» > «Вид», находим «Скрытые файлы и папки», отмечаем «Показывать скрытые файлы и папки». 

===================================

Можно воспользоваться готовым пакетным файлом;

start regsvr32 /i shell32.dll
reg add \hklm\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\Advanced\Folder\Hidden\SHOWALL /v CheckedValue /t REG_DWORD /f 1