Запускается для каждой базы через батник:
Arc.vbs Buh MyName MyPass
где Buh - имя папки с базой и создаваемого архива.
MyName, MyPass - системные переменные, хранящие имя и пароль пользователя. Знаю, что не секьюрно, но можно дать этому юзеру только права на бекап базы.
My1C, MyBases - системные переменные, хранящие путь к екзешнику 1С и к папке с базами.