Процедура сжатия виртуальных дисков подразумевает последовательное выполнение следующих шагов.

1. Загружается гостевая система (виртуальный носитель которой предполагается подвергнуть сжатию) и в меню "CD -> Capture ISO image" окна эмулируемого компьютера выбирается образ диска Virtual Disk Precompactor.iso, расположенный в директории C:\Program Files\Microsoft Virtual PC\Virtual Machine Additions. Если программа Virtual PC устанавливалась в другую директорию, путь к образу может быть иным.

2. В результате в гостевой системе появится новый диск. Его необходимо открыть и запустить расположенную на нём утилиту Microsoft Virtual Disk Pre-Compactor, предназначенную для заполнения неиспользуемого пространства на виртуальном носителе нулями.

3. Когда инструмент Virtual Disk Pre-Compactor прекратит обработку диска, потребуется завершить работу гостевой системы и через меню File эмулятора открыть менеджер дисков Virtual Disk Wizard.

4. В окне менеджера необходимо открыть закрепленный за только что выгруженной гостевой системой файл формата VHD, затем выбрать пункт Compact it и нажать Next.

5. Откроется диалоговое окно, в котором нужно указать, какие действия следует произвести после сжатия диска - сохранить его в новом файле или перезаписать поверх имеющегося.

6. После принятия окончательного решения останется только нажать кнопку Next и дождаться завершения упаковки виртуального диска.

UPD: для XP Mode нужно искать в файл c:\Program Files (x86)\Windows Virtual PC\Integration Components\Precompact.iso (для 64-разрядной системы -  c:\Program Files (x86) )