Проблемы продолжают доставать. При запуске базы 1С в формате SQL 1С ругается на драйвер ODBC. Полез в Инет. 

Решение сводится к 2-м вариантам:

1. Заменить системные файлы odbcbcp.dll, sqlsrv32.dll, sqlsrv32.rll на файлы из XP (или 2003);
2. Использовать Application Compatibility Toolkit для подмены путей

Думал использовать 2-й вариант, но не получилось. Пришлось менять файлы (нужно стать их владельцем через takeown и дать права на перезапись)